Das ABS 9 ME wird bei der 1199 Panigale und 1199 Panigale S auf Anfrage und bei der Tricolore-Version standardmäßig montiert. Hierbei handelt es sich um ein Zweikanalsystem der letzten Generation, das eine Integralbremsung mit kontrollierter Anhebung des Hinterrads vollzieht, was nicht nur geringere Bremswege, sondern auch eine höhere Stabilität beim Bremsen garantiert. Das speziell für die Sportnutzung eingestellte ABS 9ME agiert in drei Auslösestufen, von denen jede einem Riding-Mode zugeordnet ist; im RACE-Modus arbeitet das System nur auf den vorderen Bremsscheiben und garantiert somit eine optimierte Leistung bei der Nutzung auf der Rennstrecke.