Die vordere Bremsanlage verfügt über radial verschraubte Bremszangen von Brembo und einen einstellbaren Handbremshebel. Der vordere Bremsscheibendurchmesser beträgt 320 mm. Die hintere Bremsanlage verfügt über eine Bremsscheibe mit 245 mm Durchmesser und über eine Bremszange von Brembo. Die verwendeten Bremskomponenten ermöglichen eine bestmögliche Bremsleistung und gehören zu den besten Bremsanlagen auf dem Markt. Die Multistrada 1200 verfügt über ein serienmäßiges ABS. Für sichere Bremsungen in Gefahrensituationen, bei allen Fahrbedingungen. Das ABS ist abschaltbar und wird aus Sicherheitsgründen nach jedem Neustart der Zündanlage automatisch aktiviert.